Ostatnią możliwą opcją leczenia torbieli maziowej nadgarstka jest zabieg chirurgiczny polegający na usunięciu torbieli (wycięciu torbieli maziowej), jeśli jest ona zbyt bolesna, zbyt duża lub uciążliwa. Zabieg ten wykonuje się w znieczuleniu miejscowym w trybie ambulatoryjnym. Obrzęk jest następnie badany w laboratorium. Pacjent nosi opatrunek przez kilka dni, aby zapobiec infekcji. Musi również nosić ortezę nadgarstka przez dwa tygodnie, aby umożliwić stawowi odpoczynek.
