Czego (jeszcze) nie wiemy / granice
Związek przyczynowo-skutkowy a korelacja : Nawet jeśli zaobserwowano związek, nie dowodzi to, że bakterie jamy ustnej są przyczyną choroby Alzheimera. Możliwe, że choroba upośledza zdrowie jamy ustnej lub że inne czynniki (dieta, higiena, status społeczno-ekonomiczny itp.) wpływają zarówno na mikrobiotę jamy ustnej, jak i na ryzyko poznawcze.
Czynniki zakłócające : wiek, poziom wykształcenia, stan układu naczyniowego, styl życia, genetyka (np. gen APOE4), choroby współistniejące — wszystkie te czynniki mogą mieć wpływ na zdrowie jamy ustnej i mózgu.
Zmienność osobnicza : mikrobiom jamy ustnej znacznie różni się u poszczególnych osób w zależności od diety, genetyki, stylu życia, opieki stomatologicznej itp.
Brak interwencyjnych badań klinicznych : jak dotąd niewiele badań sprawdzało, czy poprawa zdrowia jamy ustnej (np. poprzez leczenie chorób dziąseł, doustne przyjmowanie probiotyków itp.) spowalnia lub zapobiega pogarszaniu się funkcji poznawczych.
Ilość, czas, próg : nie wiemy, jakie obciążenie bakteryjne lub próg inwazji są konieczne, aby wywołać efekt, ani na jakim etapie może to nastąpić (przedklinicznym, umiarkowanym, zaawansowanym).
